ESPECIAL #15: Priones.

¡Ay madre qué lío! No hago más que leer cosas acerca de los priones que se contradicen unas con otras. Vengo a que me saquéis de la confusión. Pongo la entrada fuera de «Qué es un virus», que bastante tenemos ya allí montado como para añadir esto en el mismo sitio. Al final del artículo comentamos una aplicación de reverse genetics, por cierto. Os cuento.

Vamos a ver: se supone que los priones son proteínas (glucoprótidos, pues se anclan a la membrana) que modifican su estructura de tal modo que adquieren plegamientos espaciales muy ricos en lámina beta. La modificación parece estar producida al oligomerizarse, es decir, alcanzan niveles energéticos muy bajos que favorecen una inmensa estabilidad, de hecho, son inmunes a los ataques de proteasas. ¡OJO! No existe ninguna mutación en el gen que codifica el prión, el cambio es post-traducción, es decir, estructural.

La estabilidad que mencionábamos provoca que se acumulen en el sistema nervioso, de ahí su consideración de patógeno: producen el síndrome de encefalopatía espongiforme transmisible (EET). Vale, hasta aquí la teoría, que es muy bonita, pero francamente, luego empiezo a encontrar más datos y la teoría puede irse por donde ha venido… voy a intentar ordenarlo un poco.  Sigue leyendo

ESPECIAL #14: Citomegalovirus

El citomegalovirus es un Herpes virus. Su nombre se debe  al aumento de tamaño que se ve en las células infectadas porque se  debilita del citoesqueleto.

El CMV principalmente ataca a las glándulas salivares.

El CMV, se encuentra  en todos los sitios  y en todos los grupos sociales. Infecta entre un 50% y un 85% de los adultos de los Estados Unidos. Además atraviesa la placenta, infecta a los fetos.

La mayoría de las personas sanas que son infectadas por el CMV tras nacer, sufren pocos síntomas. Algunas personas pueden sufrir síntomas como  fiebre prolongada, y una leve hepatitis. Una vez que una persona ha sido infectada, el virus quedará latente  de por vida.

Padecer la enfermedad de forma recurrente sucede muy raramente excepto en casos en que el sistema inmune esté deprimido debido a medicación o enfermedad. Para la gran mayoría de la población la infección por CMV no es un problema serio.

Eso sí, ¡ojo con la limpieza de la boca!, esa puede ser la vía de entrada.

El virus no es muy contagioso, se puede transmitir mediante efectos personales. La transmisión de este virus es fácil de prevenir, porque se suele transmitir a través de los fluidos corporales al ponerse en contacto con las manos y después con la nariz y la boca. El simple lavado de las manos con jabón y agua es efectivo a la hora de quitar el virus de las manos. Sigue leyendo

ESPECIAL #13: Los Flavivirus

Lo de los flavivirus me parece un poco complicado.

A ver si no meto la pata mucho.

Son virus ARN monocatenario (+), con envoltura (endocitosis, ¿os suena?), y poliédricos.

El genoma del virus es idéntico al mensajero de la célula que infecta, salvo que no tiene la “caperuza poli- A”, (recordad la maduración de los transcriptos 1º y su estabilidad).

La célula infectada traduce el “falso mensajero” y hace proteínas del virus y de la célula, todo a la vez. Una cadena muuuuuy larga, una poliproteína.

Pero esta proteína tan larga, no sirve para nada. Hay que cortarla en péptidos útiles. Y el primer péptido que se separa es un enzima del virus.

Este enzima es capaz de romper el resto de la proteína en péptidos individuales. Uno de esos péptidos en un enzima responsable de la síntesis de una molécula de ARN(-), que será el molde  para la síntesis del genoma de los virus hijos, (osea, ARN+).

Luego lo de siempre, se ensamblan las partículas virales y se produce la lisis.

Ya se que simplifico y mucho. Pero me parece que para 2º de Bachillerato es suficiente.

Pero sí quiero que sepan que estos bichos de mierda son los responsables de enfermedades como la fiebre amarilla o el dengue. ¿Y esto qué es? ¿El dengue? ¿la fiebre amarilla?

¿Me lo aclara alguien? Por cierto ¿alguien me dice que puñetas tiene que ver el «poli -A»?

ESPECIAL #12: Taxonomía de los virus RNA

Felipecat escribió:

El ICTV (Comite Internacionl De Taxonomía de Virus) dividió a los virus en 3 órdenes, 56 familias, más de 230 géneros y de 1500 especies según: Tipo de ácido nucleico, número de cadenas y presencia o auseNcia de envuelta lipídica.
El concepto de especie, es muy importante desde un punto de vista taxonómico. Sin embargo, solamente en 1991, la ICTV aceptó la propuesta de Regenmortel, de considerarlo como un criterio válido para la taxonomía y nomenclatura de los virus.

Los virus se agrupan en familias y subfamilias cuyo nombre se ha latinizado; por ejemplo, los virus herpes se agrupan en la familia Herpesviridae. Las subfamilias tienen el sufijo “nae”, Ej: Herpesvirinae. El otro tipo de agrupación es el género, que no se nombra en forma latinizada, por ejemplo, herpesvirus.
Por ejemplo, el virus Ebola de Kikwit se clasifica como:

Orden: Mononegavirales
Familia: Filoviridae
Género: FilovirusEspecie:
Virus Ebola Zaire

CLASIFICACIÓN DE VIRUS RNA

REOVIRIDAE:

Rotavirus: son el principal agente causal de gastroenteritis esporádicas y epidémicas en lactantes y niños pequeños (6-24 meses). El período de incubación suele ser de 1 a 3 días. Sigue leyendo

ESPECIAL #11: REVERSE GENETICS: GENÉTICA INVERSA

Vamos allá con este tema, que a mí como estudiante me llama particularmente mucho la atención porque una vez logras hacerte una idea de lo que supone, marea el tan solo plantearse dónde estaremos con esto dentro de no tantos años como creemos. A ver si lo hago medianamente bien y nos enteramos todos, yo incluido, que hasta que lo he entendido para poder hacer el artículo, tela.

La genética inversa investiga la función biológica de un fragmento de ADN secuenciado o clonado alterándolo mediante mutación. Al contrario que la genética habitual, que a partir de una función conocida pretende averiguar qué secuencia genética se encarga de ella; la genética inversa averigua a partir de una secuencia ya conocida qué fenotipo produce (al revés, vamos). Por decirlo de algún modo, la genética inversa parte del gen responsable hasta llegar a la enzima defectuosa. Para ello, se provocan cambios en dicho ADN y se observan los efectos derivados. Se realizan mutaciones ya sean puntuales (de nucleótidos) o masivas (silenciar genes completos), para luego analizar con PCR.

Veamos ahora las técnicas más conocidas: Sigue leyendo

¡CON CALMA!

Hola a todos. Ya estoy de vuelta. Lo siento, donde estaba no tenía acceso a Internet (ni me hubieran dejado).

Vamos a ver, digo yo que si vamos a seguir hablando de virus, mejor nos organizamos un poco y centramos las cosas.

1.- ¿Qué es un virus?

2.- ¿Cómo se clasifican?

3.- Virus ADN. (Porque digo yo qué también existen ¿no?)

4.- Retrovirus. (Virus dependientes de ADN, para entendernos)

5.- Virus ARN (+)

6.- Virus ARN (-)

7.- Vacunas.

No se trata de escribir los ciclos, eso entra en la asignatura. Sólo se trata de refrescar los conceptos ya conocidos o de investigar un poco en los no conocidos y señalar las pautas generales para que nadie se pierda. Ósea, por partes, como Jack el destripador.

No me gustaría asignar un punto a cada uno de vosotros, me gustaría que de forma espontánea, surgiera la información.

Con un poquito de cada punto, nadie se perdería y el blog sería más ágil. Se trata de poner orden en la cantidad de información que ya tenemos, que es mucha.

Es  mucho más de lo que tiene la mayoría de la gente.

Y¡¡ tenemos una oportunidad única que no podemos perder!!!!

ESPECIAL #10: Nomenclatura de los virus influenza

Manulanza escribió:

Bueno, este es mi primer comentario. Según he podido encontar, existe una nomenclatura estándar (internacionalmente aceptada) para los virus influenza, donde se especifica el tipo viral, la localización geográfica en la que se aisló por primera vez, el número secuencial de la cepa, el año de aislamiento de la misma (dos últimos dígitos) y los subtipos de hemoaglutinina y neuraminidasa entre paréntesis (por ejemplo (H1N1)). En el caso de aislamientos realizados en animales, se debe incluir, además, la especie de origen en inglés.

Es decir, en el ejemplo que nos puso Alicia: A/Swine/Wisconsin/14094/99:

– el virus sería del tipo A,

– la especie de origen sería el cerdo (swine es cerdo en inglés),

– se aisló por primera vez en el estado de Winsconsin en EEUU,

– 14094 sería el número secuencial de la cepa

– y 99 el año en que se produjo su aislamiento.

Vacunas inactivadas y con virus atenuados

Pongo aparte el comentario de Alicia en la entrada de vacunas de Pilar. Al final tenéis los artículos que nos propone realizar. No os perdáis su comentario en la entrada ARN en retrovirus, aclara muchos conceptos que por parecer aparentes terminamos confundiendo, además de animarnos a buscar información sobre la taxonomía de los virus. A lo que íbamos:

  • Alicia Solórzano comentó:

Vacunas hay ahora mismo de dos tipos: Inactivadas y con virus vivos atenuados. De hecho yo me considero una experta en el último tipo, que son mucho más prometedoras.
Las vacunas se basan en introducir un antígeno para que el cuerpo desarrolle una respuesta inmune. Básicamente lo que hacían antes era crecer el virus, matarlo e inyectarlo.

Como sabéis las vacunas se cambian cada año y eso es debido a que hay pequeñas (o grandes) mutaciones en las glicoproteínas de la superficie viral, la HA y la NA, que son los principales antígenos que nuestro cuerpo reconoce. Lo que pasa es que generamos anticuerpos un año, pero como cada año el virus muta, no nos sirven nuestros viejos anticuerpos y tenemos que hacer nuevos.

Y ahí entran las vacunas. Es mejor inducir una respuesta immune en la persona con antígenos exógenos antes de que el virus llegue, así cuando llega, los anticuerpos lo pueden neutralizar. Sigue leyendo

Modelo 3D de un virus ARN con potencial para combatir el cáncer y el VIH

Llevamos unos días con los virus que no paramos. No nos olvidemos  del especial que llevamos a cabo acerca de la gripe, aún tenemos que publicar la relación de gripe y vacunas específicas por especie que nos propuso Alicia. De momento, vamos con la noticia que nos ocupa.

El VSV (por sus siglas en inglés vesicular stomatitis virus) ha sido estudiado durante mucho tiempo como el modelo para comprender el ciclo vírico de los virus con ARN antisentido, entre los que se incluyen los causantes de la gripe o la rabia. Es más, las investigaciones recientes han sacado a la luz que el VSV además tiene un enorme potencial para ser modificado genéticamente y servir así como agente antitumoral, pues cuenta con una especificidad y una capacidad selectiva altísima a la hora de diferenciar entre células cancerosas y células sanas, así como un potente vehículo contra el VIH.   Sigue leyendo

ESPECIAL #09: ARN en retrovirus

Vamos a ver si aclaramos términos. (Esto es un poco largo, paciencia)

Un hebra de ADN que se usa para formar un ARN mensajero, se llama “antisentido”, luego la hebra “idéntica” (salvo la T/U) al mensajero es la hebra “sentido”. ¡OJO! Porque si usamos la expresión “codificante”, no queda claro si nos referimos a la hebra que “codifica” para el mensajero o a su complementaria.

De la misma forma, el ARN sentido (o sentido +), es la hebra de mensajero que se traduce a proteínas. Por lo mismo, el ARN anti-sentido (sentido -), es la hebra complementaria a la anterior. (Ya hablaremos un poco más delante de esto).

Pues bien, hay virus ARN que pasan su información a ADN, lo integran en los cromosomas de la célula infectada, y siguiendo el Dogma central, se apoderan de la maquinaria celular en su beneficio. El año pasado vimos uno de estos virus, el V.I.H.

Pero hay retrovirus (virus ARN) cuyo genoma es ARN sentido +, es decir, su ARNv es ya un ARN que se puede usa directamente como mensajero para su traducción directa. Sigue leyendo

ESPECIAL #08: Gripe. Vacunación.

Vucunas vivas atenuadasPartiendo del comentario de Gema y de la información ampliada por Sergio en el artículo «Gripe. Combinaciones HA y NA» vamos a hablar sobre sus tratamientos, sobre las vacunas disponibles en el mercado.

Atentiendo a su composición, las vacunas antigripales se pueden clasificar en:

1. Vacunas de virus inactivados

2.Vacunas de virus vivos atenuados

1. VACUNAS DE VIRUS INACTIVADOS

    Los microorganismos que las componen están muertos, no se pueden reproducir y por eso, tienen que aplicarse en dosis repetidas y potentes para así perpetuar la inmunización. La inactivación de esos microorganismos se consigue por productos químicos como el formol o aplicando calor extremo.

    Las vacunas inactivadas disponibles en España son trivalentes (inyecciones de cepas combinadas) suelen contener dos cepas del virus A (H1N1, H3N2) y una del virus B. El virus H3N2 es el más inestable y durante las últimas temporadas ha obligado a corregir la composición de la vacuna en repetidas ocasiones. Sigue leyendo

    Primer descubrimiento de progesterona en plantas

    Muchas, muchas noticias. Hoy tenemos muchas noticias de las que hablar. A esta todavía le siguen otras dos bombas que publicaré entre hoy y mañana. Por supuesto, no debemos olvidarnos de la línea abierta por nuestra experta Alicia acerca de la gripe, la cual ya hemos comenzado en la entrada anterior.

    El descubrimiento del que hablamos ha supuesto una auténtica vuelta de tuerca para los científicos de medio mundo y parte del otro. Si bien ya se había identificado con anterioridad la existencia de sustancias similares a la progesterona en plantas, solamente se había especulado acerca de la posibilidad de la presencia de la propia hormona. Sigue leyendo

    ESPECIAL #07: Gripe. Combinaciones HA y NA

    Alicia Solórzano nos propuso, en la anterior entrada, realizar tres líneas de investigación: qué tipos de virus circulan en cada especie, qué tipo de vacunas se desarrollan para cada especie y cuántos tipos de HA y NA existen y qué animales se consideran reservorio natural de la gripe. Yo, para no perder la costumbre, empiezo por el final.

    El virus de la gripe, aunque inusual, no posee un genoma característico de ácido nucleico, sino que contiene entre siete u ocho fragmentos de ARN inverso. Se trata, por tanto, de un retrovirus, que infecta a las células gracias a la actividad de una enzima transcriptasa inversa, que permite el paso a ADN y su posterior ensamblamiento con el ADN celular. Comprende cinco géneros:

    • Influenza virus A
    • Influenza virus B 
    • Influenza virus C
    • Isavirus
    • Thogotovirus

    La gripe viene causada únicamente por los tres primeros, los Influenza. Sigue leyendo

    Neglected viruses

    Contamos en el blog con una invitada de honor, Alicia Solórzano, con quien teníamos intención de contactar y que finalmente se presentó así en el comentario anterior:

    «Me llamo Alicia y soy una antigua alumna del Colegio del Santo Angel en Palencia. Soy bióloga… y alguien que vosotros conocéis muy bien tiene la culpa de que yo me dedique a esto. Más en concreto me dedico a la virología y casi exclusivamente a la investigación del virus de la gripe. Aunque trabajo en la Universidad de Maryland (EEUU) ahora estoy en Florida en un congreso sobre “Neglected influenza viruses”. Alguien me podría decir a qué llaman “neglected influenza”???

    Si me contestáis, os escribiré más cosas contándoos lo que hago y a lo mejor consigo que el virus de la gripe os parezca tan interesante como me parece a mí…Un abrazo

    Alicia Solórzano

    Así que vamos a intentar responder, a ver si entre todos sacamos algo en claro acerca del tema que nos propone. Aporto lo que he podido encontrar:

    Se conoce con el nombre de «neglected diseases» a un grupo de enfermedades tropicales que son particularmente endémicas en zonas de bajo desarrollo en África, Asia y América (el mal de Chagas es una de ellas). Comparadas con los más importantes a escala mundial (VIH/SIDA, malaria y tuberculosis), no reciben la misma atención ni mediática ni médica, a pesar de que en muchos casos llegan a empeorar la mortandad causada por las tres mencionadas.

    «Neglected disease» es literalmente en español «enfermedad descuidada«. Concretamente, y por lo que he podido leer, «neglected influenza» estaría haciendo referencia al virus de la gripe que infecta a pequeños mamíferos y que tiene la capacidad de saltar a otros animales o incluso al hombre. Y viceversa: del hombre puede hacerse también extensivo a animales. Cerdos, perros, caballos, mamíferos acuáticos…

    De momento es lo más importante que he encontrado. Aportad más datos si los encontráis, y esperemos a que nuestra experta particular nos lo confirme^^